Mange skadelige svampe kan være skyld i rodsygdomme. Det gælder Fusarium, Phytophthora, Phytium etc.
Ofte ses brune eller slatne rødder, men det kan være meget svært at bestemme hvilken sygdom det drejer sig om.
Derfor er det også svært at sige noget generelt om bekæmpelse, men hold en god hygiejne (smid f.eks. plantesække fra drivhuset ud, hvis planterne der vokser deri får rodsygdomme), praktisér sædskifte i køkkenhaven.
I erhvervsgartnerier bruges produktet 'Supresivit' ofte som forebyggende behandling. 'Supresivit' indeholder en nyttesvamp, der kan udkonkurrere en del skadelige svampe i jorden.